· COLECCIONES VEGETALES: Podemos distinguir tres tipos:

a) Colecciones de semillas de especies andaluzas
en el Banco de Germoplasma Vegetal Andaluz. Estas se recogen para asegurar su conservación.

b) Colecciones vegetales de plantas vivas en el jardín.
La mayor parte del jardín está dedicada, básicamente, a la flora andaluza, bien sea silvestre o de interés económico actual o potencial. Podemos destacar:

- Arboretum: colección de plantas leñosas cosmopolitas. Está formado por árboles y arbustos simulando un bosque natural. Éstos se agrupan según sus características fisionómicas, árboles de hoja caduca o perenne, palmeras, coníferas.

- Rosaleda: colección de diversas variedades del género Rosa, distribuidas alrededor de un estanque octogonal y situada junto al Arboretum.

- Jardín Tacto-Olfativo: colección de plantas fácilmente reconocibles por su tacto y olor, de especial interés para invidentes. (etiqueta en Braille).

- La Escuela Agrícola: colección de plantas de gran interés económico para e hombre: hortícolas, frutales, tintóreas, encurtidoras, azucareras, aromáticas y medicinales.

- Colección Sistemática: constituida por plantas ordenadas según parentesco o proximidad filogenética.



- Invernaderos de Flora Canaria y Endemismos: colección de endemismos Canarios, Andaluces y Baleáricos en los invernaderos situados en la Plaza Central del Jardín Botánico. Estos invernaderos constan de tres módulos:
MÓDULO I:
Con temperatura suave y alta humedad relativa, contiene una colección de plantas criptógamas con especies tanto de clima templado como tropical, Se observan colecciones de helechos y endemismos de origen andaluz y balear, entre los que destaca "Artemisa granatensis" y "Aquilegia cazorlensis".
MÓDULO II Y III:
El primero de ambiente cálido-húmedo con componentes de laurisilva, fayal y brezal; y el segundo más xérico y cálido con especies de tabaibos, cardones y pinar. Ambos exhiben una colección de Flora Canaria que contiene unas 130 especies diferentes.

- Invernaderos de Flora Americana. Está distribuida en tres pabellones, templado-húmedo. cálido y xerofítico, en los que encontraremos especies de las familias Araceas, Amarantáceas, Orquidáceas, Bromeliaceas, Cactáceas y otras especies americanas de interés económico agrupadas por su uso.

- Colección de plantas en peligro de extinción que viven en poblaciones no aisladas, en el observatorio.

c) Colección de fósiles vegetales.
Se encuentra en el Museo de Paleobotánica, en el cual podemos observar hasta 180.000 fósiles vegetales, de los cuales la base de la colección está centrada en la paleoflora andaluza. Paralelamente, existe una pequeña colección que representa la paleoflora mundial.

a) Museo de Etnobotánica:
Fue inaugurado en septiembre de 1992, junto con los Invernaderos de Flora Americana, durante la celebración del Congreso Internacional de Etnobotánica 92. La idea surgió como homenaje a los pueblos indígenas de América, los cuales hemos heredado no sólo una gran cantidad de plantas, sino también sus conocimientos sobre las utilidades de esas especies, formas de explotación y aprovechamiento, así como la mejora y selección de muchos cultivos a través de cientos de generaciones. El museo consta de cuatro salas de exposición. Tres de ellas de exposición permanente, tratan de mostrar la relación cultural hombre/planta a través de una gran variedad de objetos etnobotánicos, módulos instalados con sistemas de transiluminación, piezas de museo, piezas de museo, paneles interactivos y documentación gráfica, acabando con una reflexión sobre la trascendencia de la conservación de la biodiversidad del planeta. La cuarta sala está dedicada a exposiciones itinerantes. En el centro del museo está el Auditorio, con una capacidad para 250 personas dedicado para la celebración de congresos, seminarios o cualquier otra actividad cultural.



b) Museo de Paleobotánica:
Se encuentra edificado en el molino de agua llamado Molino de la Alegría que se encuentra en la ribera del Guadalquivir junto al Jardín Botánico. El molino está en trámites de restauración. A principio de siglo XX se añadieron dos plantas donde se ubicará el Museo de Paleobotánica. La restauración del Molino se está terminando según las directrices de la Consejería de Cultura, por ser de interés histórico, y la de Medio Ambiente, por pasar por delante de una cañada ganadera que tiene que ser respetada. Al Museo se accederá mediante una pasarela que lo unirá al Jardín Botánico por encima de la cañada.
La colección de fósiles de Jardín Botánico de Córdoba tiene como base la colección del profesor Roberto Wagner, que consta de más de 150.000 ejemplares exclusivamente de fósiles vegetales, en sus edades carbonífera y pérmica, sobre todo de procedencia española, aunque también existe una buena representación de otras edades y de distintas partes del mundo. A gran parte de los ejemplares les acompaña fotografías ampliadas, lo que permitirá reconocer y apreciar detalles que presentan, y que normalmente solo se aprecian usando la lupa.

c) Laboratorios y biblioteca específicos:
Ambos son importantes fuentes de documentación. Hemos de destacar el Herbario donde se encuentra catalogada todas las plantas existentes en el jardín. Incluye unos 75.000 pliegos de plantas prensadas y desecadas procedentes fundamentalmente de Andalucía, y está especializado en especies de la familia Crucíferas, malas hierbas de cultivo.

Es una instalación aislada del resto del jardín, propiedad de la Junta de Andalucía. Está dedicado a la conservación del Patrimonio Genético Español y de forma más especial del andaluz.
Con la técnica de cultivo in Vitro se ha logrado reproducir varias especies que son exclusivas del territorio andaluz y que se encontraban la borde de la extinción.

- Señalización básica del jardín, donde podemos guiarnos por diferentes zonas del mismo según distintos planos.
- Señalización de cada área, por ejemplo, del arboretum, los invernaderos, etc. Además podemos obtener información de la actividad que podemos realizar en cada una de ellas.
- Señalización mediante etiquetas que nos indican el nombre común y científico de cada especie.

· Además de todo esto, el Jardín tiene fácil acceso a minusválidos ya que no existen barreras arquitectónicas. Un área curiosa a destacar sería el Jardín tacto-olfativo, especialmente diseñado para invidentes. Las plantas que en él se encuentran son fácilmente reconocibles por su olor y su tacto, las etiquetas están escritas en Braille y el suelo presenta un enlosado diferente lo que permite, a una persona invidente, realizar un recorrido por esta área guiándose por él.
Respecto a los equipamientos de uso público podemos encontrar: teléfono, servicios (perfectamente adaptados a minusválidos), salón de actos y aulas que pueden ser utilizadas por toda aquella persona que las solicite.